Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
POLA1P09884 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
POLA1P09884 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
POLA1P09884 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
POLA1P09884 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
POLA1P09884 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLA1P09884 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLA1P09884 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLA1P09884 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
POLA1P09884 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLA1P09884 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLA1P09884 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLA1P09884 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
POLA1P09884 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
POLA1P09884 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
POLA1P09884 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
POLA1P09884 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
POLA1P09884 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
POLA1P09884 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
POLA1P09884 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
POLA1P09884 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
POLA1P09884 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
POLA1P09884 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLA1P09884 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
POLA1P09884 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
POLA1P09884 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
POLA1P09884 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
POLA1P09884 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
POLA1P09884 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
POLA1P09884 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
POLA1P09884 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
POLA1P09884 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
POLA1P09884 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
POLA1P09884 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
POLA1P09884 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
POLA1P09884 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
POLA1P09884 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
POLA1P09884 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
POLA1P09884 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
POLA1P09884 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
POLA1P09884 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
POLA1P09884 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
POLA1P09884 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
POLA1P09884 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
POLA1P09884 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
POLA1P09884 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
POLA1P09884 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
POLA1P09884 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLA1P09884 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLA1P09884 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLA1P09884 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLA1P09884 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
POLA1P09884 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLA1P09884 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLA1P09884 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
POLA1P09884 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
POLA1P09884 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
POLA1P09884 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
POLA1P09884 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLA1P09884 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLA1P09884 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLA1P09884 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLA1P09884 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLA1P09884 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLA1P09884 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLA1P09884 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLA1P09884 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
POLA1P09884 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
POLA1P09884 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
POLA1P09884 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
POLA1P09884 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
POLA1P09884 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
POLA1P09884 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
POLA1P09884 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
POLA1P09884 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
POLA1P09884 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
POLA1P09884 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
POLA1P09884 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
POLA1P09884 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLA1P09884 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLA1P09884 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLA1P09884 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLA1P09884 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLA1P09884 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLA1P09884 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLA1P09884 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLA1P09884 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLA1P09884 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms