Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHCP07864 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHCP07864 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHCP07864 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHCP07864 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHCP07864 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHCP07864 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHCP07864 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHCP07864 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHCP07864 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHCP07864 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHCP07864 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHCP07864 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHCP07864 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHCP07864 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHCP07864 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHCP07864 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHCP07864 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHCP07864 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHCP07864 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHCP07864 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHCP07864 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHCP07864 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHCP07864 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHCP07864 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHCP07864 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHCP07864 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHCP07864 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHCP07864 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHCP07864 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHCP07864 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHCP07864 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHCP07864 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHCP07864 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHCP07864 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHCP07864 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHCP07864 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHCP07864 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHCP07864 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHCP07864 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHCP07864 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHCP07864 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHCP07864 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHCP07864 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHCP07864 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHCP07864 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHCP07864 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHCP07864 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHCP07864 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDHCP07864 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDHCP07864 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDHCP07864 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDHCP07864 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDHCP07864 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDHCP07864 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDHCP07864 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDHCP07864 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDHCP07864 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDHCP07864 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDHCP07864 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDHCP07864 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LDHCP07864 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LDHCP07864 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LDHCP07864 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LDHCP07864 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDHCP07864 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDHCP07864 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LDHCP07864 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDHCP07864 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDHCP07864 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDHCP07864 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDHCP07864 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDHCP07864 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDHCP07864 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDHCP07864 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms