Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms