Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCCAP05165 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCCAP05165 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCCAP05165 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCCAP05165 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCCAP05165 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCCAP05165 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCCAP05165 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCCAP05165 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCCAP05165 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PCCAP05165 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCCAP05165 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCCAP05165 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCCAP05165 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCCAP05165 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCCAP05165 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCCAP05165 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCCAP05165 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCCAP05165 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCCAP05165 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCCAP05165 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCCAP05165 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCCAP05165 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCCAP05165 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCCAP05165 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCCAP05165 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PCCAP05165 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCCAP05165 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCCAP05165 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCCAP05165 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCCAP05165 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCCAP05165 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCCAP05165 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCCAP05165 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCCAP05165 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCCAP05165 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCCAP05165 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCCAP05165 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCCAP05165 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCCAP05165 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCCAP05165 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCCAP05165 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCCAP05165 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCCAP05165 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCCAP05165 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCCAP05165 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PCCAP05165 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCCAP05165 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCCAP05165 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCCAP05165 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCCAP05165 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PCCAP05165 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCCAP05165 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCCAP05165 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCCAP05165 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCCAP05165 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCCAP05165 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCCAP05165 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PCCAP05165 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCCAP05165 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCCAP05165 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCCAP05165 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCCAP05165 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCCAP05165 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCCAP05165 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCCAP05165 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCCAP05165 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCCAP05165 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCCAP05165 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCCAP05165 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCCAP05165 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCCAP05165 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCCAP05165 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCCAP05165 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCCAP05165 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCCAP05165 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCCAP05165 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms