Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
F13BP05160 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
F13BP05160 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
F13BP05160 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
F13BP05160 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13BP05160 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13BP05160 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13BP05160 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13BP05160 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13BP05160 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13BP05160 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13BP05160 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13BP05160 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13BP05160 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13BP05160 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13BP05160 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13BP05160 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13BP05160 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13BP05160 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13BP05160 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13BP05160 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13BP05160 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13BP05160 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13BP05160 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13BP05160 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13BP05160 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13BP05160 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
F13BP05160 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
F13BP05160 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F13BP05160 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
F13BP05160 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
F13BP05160 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F13BP05160 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
F13BP05160 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
F13BP05160 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
F13BP05160 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
F13BP05160 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
F13BP05160 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13BP05160 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F13BP05160 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F13BP05160 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
F13BP05160 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F13BP05160 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
F13BP05160 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
F13BP05160 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
F13BP05160 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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