Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP1A1P05023 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A1P05023 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms