Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYBBP04839 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYBBP04839 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYBBP04839 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYBBP04839 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYBBP04839 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYBBP04839 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYBBP04839 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYBBP04839 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYBBP04839 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYBBP04839 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYBBP04839 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYBBP04839 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYBBP04839 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYBBP04839 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYBBP04839 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYBBP04839 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYBBP04839 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYBBP04839 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYBBP04839 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYBBP04839 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYBBP04839 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYBBP04839 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYBBP04839 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYBBP04839 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYBBP04839 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYBBP04839 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYBBP04839 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYBBP04839 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYBBP04839 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYBBP04839 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYBBP04839 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYBBP04839 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYBBP04839 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYBBP04839 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYBBP04839 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYBBP04839 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYBBP04839 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYBBP04839 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYBBP04839 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYBBP04839 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms