Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC2P02655 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC2P02655 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC2P02655 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC2P02655 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC2P02655 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC2P02655 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC2P02655 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC2P02655 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC2P02655 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC2P02655 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC2P02655 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC2P02655 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC2P02655 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC2P02655 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC2P02655 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC2P02655 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC2P02655 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC2P02655 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC2P02655 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC2P02655 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC2P02655 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC2P02655 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC2P02655 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC2P02655 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC2P02655 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC2P02655 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC2P02655 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC2P02655 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC2P02655 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms