Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P00740 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P00740 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P00740 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P00740 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P00740 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P00740 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P00740 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P00740 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P00740 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P00740 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P00740 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P00740 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P00740 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
F9P00740 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
F9P00740 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P00740 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P00740 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P00740 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P00740 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P00740 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P00740 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P00740 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P00740 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P00740 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P00740 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P00740 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms