Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX11BO96011 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX11BO96011 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms