Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX58O95786 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX58O95786 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX58O95786 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX58O95786 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX58O95786 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX58O95786 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX58O95786 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX58O95786 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX58O95786 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX58O95786 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX58O95786 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX58O95786 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX58O95786 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX58O95786 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX58O95786 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX58O95786 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX58O95786 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX58O95786 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX58O95786 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX58O95786 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX58O95786 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX58O95786 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX58O95786 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX58O95786 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX58O95786 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX58O95786 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX58O95786 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX58O95786 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DDX58O95786 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DDX58O95786 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX58O95786 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX58O95786 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX58O95786 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX58O95786 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX58O95786 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX58O95786 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX58O95786 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX58O95786 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX58O95786 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX58O95786 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX58O95786 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX58O95786 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX58O95786 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX58O95786 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX58O95786 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX58O95786 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX58O95786 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX58O95786 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX58O95786 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX58O95786 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX58O95786 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX58O95786 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX58O95786 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX58O95786 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX58O95786 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX58O95786 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX58O95786 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX58O95786 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX58O95786 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX58O95786 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX58O95786 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX58O95786 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX58O95786 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX58O95786 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX58O95786 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX58O95786 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX58O95786 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX58O95786 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX58O95786 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX58O95786 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX58O95786 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms