Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FARP2O94887 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FARP2O94887 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FARP2O94887 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FARP2O94887 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FARP2O94887 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP2O94887 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP2O94887 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP2O94887 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP2O94887 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP2O94887 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP2O94887 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP2O94887 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP2O94887 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FARP2O94887 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP2O94887 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP2O94887 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP2O94887 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP2O94887 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP2O94887 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP2O94887 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP2O94887 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP2O94887 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FARP2O94887 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP2O94887 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP2O94887 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP2O94887 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP2O94887 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP2O94887 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP2O94887 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP2O94887 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP2O94887 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP2O94887 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FARP2O94887 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FARP2O94887 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP2O94887 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP2O94887 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP2O94887 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP2O94887 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP2O94887 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP2O94887 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP2O94887 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP2O94887 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FARP2O94887 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FARP2O94887 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP2O94887 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP2O94887 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP2O94887 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP2O94887 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP2O94887 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FARP2O94887 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP2O94887 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP2O94887 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP2O94887 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP2O94887 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP2O94887 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP2O94887 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FARP2O94887 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FARP2O94887 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP2O94887 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP2O94887 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP2O94887 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP2O94887 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP2O94887 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP2O94887 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP2O94887 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms