Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM2O94769 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM2O94769 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM2O94769 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM2O94769 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM2O94769 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM2O94769 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM2O94769 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM2O94769 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM2O94769 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM2O94769 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM2O94769 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM2O94769 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM2O94769 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM2O94769 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM2O94769 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM2O94769 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM2O94769 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM2O94769 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM2O94769 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM2O94769 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM2O94769 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM2O94769 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM2O94769 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM2O94769 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM2O94769 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM2O94769 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM2O94769 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM2O94769 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM2O94769 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM2O94769 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM2O94769 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM2O94769 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM2O94769 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM2O94769 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM2O94769 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM2O94769 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM2O94769 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM2O94769 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM2O94769 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM2O94769 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM2O94769 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM2O94769 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM2O94769 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM2O94769 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM2O94769 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM2O94769 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM2O94769 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms