Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLOT1O75955 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLOT1O75955 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms