Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KA4O75676 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPS6KA4O75676 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA4O75676 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms