Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F6O75461 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F6O75461 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F6O75461 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F6O75461 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F6O75461 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F6O75461 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F6O75461 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F6O75461 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F6O75461 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F6O75461 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F6O75461 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F6O75461 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F6O75461 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F6O75461 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F6O75461 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F6O75461 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F6O75461 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F6O75461 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F6O75461 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F6O75461 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F6O75461 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F6O75461 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F6O75461 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F6O75461 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F6O75461 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F6O75461 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F6O75461 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F6O75461 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F6O75461 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F6O75461 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F6O75461 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F6O75461 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F6O75461 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F6O75461 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F6O75461 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F6O75461 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F6O75461 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F6O75461 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F6O75461 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F6O75461 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms