Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP3O75386 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP3O75386 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP3O75386 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP3O75386 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP3O75386 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP3O75386 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP3O75386 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP3O75386 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP3O75386 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP3O75386 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP3O75386 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP3O75386 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP3O75386 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP3O75386 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TULP3O75386 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TULP3O75386 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TULP3O75386 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP3O75386 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP3O75386 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP3O75386 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP3O75386 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP3O75386 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP3O75386 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP3O75386 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP3O75386 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP3O75386 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP3O75386 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms