Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2O75044 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms