Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3BO60391 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms