Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KIAA0556O60303 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KIAA0556O60303 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms