Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA2O43921 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms