Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP9BO43861 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms