Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH3O43739 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH3O43739 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms