Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN6O43657 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms