Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8B1O43520 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms