Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms