Protein–RNA interactions for Protein: O43396

TXNL1, Thioredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1O43396 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TXNL1O43396 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNL1O43396 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms