Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF3O43395 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF3O43395 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms