Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCAO15360 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCAO15360 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCAO15360 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCAO15360 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCAO15360 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FANCAO15360 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FANCAO15360 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCAO15360 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCAO15360 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCAO15360 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCAO15360 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCAO15360 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCAO15360 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCAO15360 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCAO15360 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCAO15360 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCAO15360 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCAO15360 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCAO15360 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCAO15360 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCAO15360 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCAO15360 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCAO15360 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCAO15360 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCAO15360 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCAO15360 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCAO15360 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCAO15360 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCAO15360 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCAO15360 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCAO15360 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCAO15360 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCAO15360 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCAO15360 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCAO15360 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
FANCAO15360 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
FANCAO15360 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCAO15360 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCAO15360 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCAO15360 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCAO15360 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCAO15360 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCAO15360 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCAO15360 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCAO15360 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCAO15360 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCAO15360 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCAO15360 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCAO15360 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCAO15360 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCAO15360 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCAO15360 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCAO15360 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCAO15360 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCAO15360 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCAO15360 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCAO15360 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCAO15360 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCAO15360 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCAO15360 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCAO15360 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCAO15360 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCAO15360 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCAO15360 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCAO15360 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCAO15360 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCAO15360 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCAO15360 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCAO15360 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCAO15360 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCAO15360 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCAO15360 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCAO15360 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms