Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHADO15335 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHADO15335 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHADO15335 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHADO15335 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHADO15335 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHADO15335 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHADO15335 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHADO15335 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
CHADO15335 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHADO15335 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHADO15335 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHADO15335 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHADO15335 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHADO15335 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHADO15335 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHADO15335 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHADO15335 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHADO15335 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHADO15335 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHADO15335 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHADO15335 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHADO15335 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHADO15335 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHADO15335 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHADO15335 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms