Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WNT9AO14904 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT9AO14904 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms