Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPEF2O14830 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPEF2O14830 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms