Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms