Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CITO14578 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CITO14578 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CITO14578 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CITO14578 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CITO14578 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CITO14578 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CITO14578 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CITO14578 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CITO14578 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CITO14578 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CITO14578 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CITO14578 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CITO14578 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CITO14578 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CITO14578 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CITO14578 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CITO14578 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CITO14578 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CITO14578 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CITO14578 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CITO14578 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CITO14578 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CITO14578 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CITO14578 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CITO14578 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CITO14578 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CITO14578 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CITO14578 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CITO14578 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CITO14578 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CITO14578 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CITO14578 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CITO14578 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITO14578 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITO14578 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITO14578 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITO14578 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITO14578 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CITO14578 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITO14578 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITO14578 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITO14578 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITO14578 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CITO14578 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CITO14578 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CITO14578 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CITO14578 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CITO14578 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CITO14578 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms