Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms