Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP56O00567 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP56O00567 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP56O00567 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP56O00567 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP56O00567 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP56O00567 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP56O00567 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP56O00567 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP56O00567 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP56O00567 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP56O00567 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP56O00567 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP56O00567 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP56O00567 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP56O00567 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP56O00567 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP56O00567 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP56O00567 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP56O00567 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms