Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGPSO00116 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGPSO00116 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGPSO00116 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGPSO00116 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGPSO00116 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGPSO00116 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGPSO00116 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGPSO00116 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGPSO00116 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGPSO00116 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGPSO00116 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGPSO00116 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGPSO00116 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGPSO00116 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AGPSO00116 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGPSO00116 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGPSO00116 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPSO00116 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPSO00116 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPSO00116 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPSO00116 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPSO00116 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPSO00116 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPSO00116 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPSO00116 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPSO00116 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPSO00116 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPSO00116 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPSO00116 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPSO00116 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPSO00116 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPSO00116 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPSO00116 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms