Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms