Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC188H7C350 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC188H7C350 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms