Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN34H7C241 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN34H7C241 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN34H7C241 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN34H7C241 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN34H7C241 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN34H7C241 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN34H7C241 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN34H7C241 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN34H7C241 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms