Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H7C0C1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H7C0C1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
H7C0C1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H7C0C1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H7C0C1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H7C0C1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H7C0C1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C0C1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C0C1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C0C1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C0C1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C0C1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C0C1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C0C1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C0C1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C0C1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C0C1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C0C1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C0C1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C0C1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C0C1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C0C1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C0C1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C0C1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C0C1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C0C1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C0C1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C0C1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C0C1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms