Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA8SH3BPF8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms