Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB6E9PJ23 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPB6E9PJ23 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms