Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms