Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PBE3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PBE3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PBE3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PBE3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PBE3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PBE3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PBE3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PBE3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PBE3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PBE3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PBE3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PBE3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PBE3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PBE3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PBE3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PBE3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PBE3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PBE3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PBE3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PBE3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PBE3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
E9PBE3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PBE3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PBE3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms