Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1CA8MV81 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1CA8MV81 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1CA8MV81 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1CA8MV81 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1CA8MV81 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1CA8MV81 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1CA8MV81 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1CA8MV81 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms