Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNZ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNZ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNZ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNZ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNZ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNZ2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNZ2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNZ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNZ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNZ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNZ2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNZ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNZ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNZ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNZ2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNZ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNZ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNZ2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNZ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNZ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NNZ2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNZ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNZ2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NNZ2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NNZ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NNZ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NNZ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NNZ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NNZ2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NNZ2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NNZ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NNZ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NNZ2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NNZ2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NNZ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NNZ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NNZ2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NNZ2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNZ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNZ2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNZ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNZ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNZ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNZ2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNZ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms