Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR42E2A6NKP2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms