Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf118A6NHY6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms