Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM247A6NEH6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms